Ter voorbereiding van een medische ingreep is het mogelijk om een patiënt-specifiek anatomisch model te printen, gemaakt vanuit beeldvormende technieken (bijv. CT- of MRI scans). Een anatomische model geeft de patiënt en medisch specialist meer inzicht over het ziektebeeld en de behandeling, zowel voor als tijdens de operatie.
Het 3D printen van anatomische modellen zorgt daarnaast voor een heldere uitleg aan de patiënt. Door gebruik te maken van 3D printen, begrijpt de patiënt beter wat zich in het lichaam afspeelt. Daarnaast helpt het bij het accepteren van een ziekte. De patiënt kan de directe omgeving laten zien hoe zijn aandoening eruit ziet en daardoor beter uitleggen wat de ziekte precies inhoudt en het mentaal een plek geven.
Tot slot worden anatomische modellen ingezet als uitlegmodel aan co-assistenten en arts-assistenten.